In silico μελέτες βιοδραστικών μορίων που δρουν σε κυτταρικό επίπεδο ή πρωτεϊνικούς υποδοχείς
Περίληψη
Στην παρούσα διδακτορική διατριβή πραγματοποιήσαμε μια εκτεταμένη έρευνα σχετικά με τις δυνατότητες των φυσικών προϊόντων και των αντιυπερτασικών μορίων ως αναστολέων που στοχεύουν στις βασικές πρωτεΐνες του ιού SARS-CoV-2, συγκεκριμένα την Κύρια Πρωτεάση (Mpro) και την Πρωτεΐνη Ακίδα (S). Χρησιμοποιώντας τη μέθοδο της Επαγόμενης Μοριακής Πρόσδεσης αξιολογήσαμε τη δεσμευτική ικανότητα τους με τη Mpro (σε μια περιοχή πρόσδεσης) και την πρωτεΐνη S ενωμένη με το Μετατρεπτικό Ένζυμο της Αγγειοτασίνης ΙΙ (ACE2) (τρεις διαφορετικές περιοχές πρόσδεσης). Για να αποκτήσουμε βαθύτερες γνώσεις σχετικά με τη σταθερότητα και τις μοριακές αλληλεπιδράσεις των συμπλεγμάτων «πρωτεΐνης-προσδέτη», τα οποία προέκυψαν από τις μελέτες Μοριακής Πρόσδεσης, πραγματοποιήσαμε προσομοιώσεις Μοριακής Δυναμικής. Αυτές οι προσομοιώσεις μπορεί να διαλευκάνουν στους μοριακούς μηχανισμούς που αποτελούν τη βάση των πιθανών υποψηφίων φαρμάκων για τη θεραπεία της COVID-19. Επιπλέον, πραγματοποιήσαμε υπολογισμούς MM-GBSA σ ...
περισσότερα
Περίληψη σε άλλη γλώσσα
In this dissertation, we conducted an extensive investigation into the potential of natural products and anti-hypertensive molecules as inhibitors targeting key proteins of the SARS-CoV-2 virus, specifically the main protease (Mpro) and the spike (S) protein. Employing Induced Fit Docking (IFD), we assessed how well these molecules bound to these critical viral components. To gain deeper insights into the stability and molecular interactions of the resulting "protein-ligand" complexes from our docking studies, we conducted Molecular Dynamics (MD) simulations. These simulations shed light on the molecular mechanisms that underlie potential drug candidates for COVID-19 treatment. Additionally, we utilized MM-GBSA calculations on all "protein-ligand" complexes, highlighting the strong binding capabilities of rosmarinic acid, curcumin, and quercetin against Mpro, and salvianolic acid B, rosmarinic acid, and quercetin against the S protein. To further expand our search for potent inhibitors ...
περισσότερα
Κατεβάστε τη διατριβή σε μορφή PDF (12.1 MB)
(Η υπηρεσία είναι διαθέσιμη μετά από δωρεάν εγγραφή)
|
Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.
|
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.