Συστημική αποκωδικοποίηση του ανθρώπινου uniquome: εξελικτικές, μηχανιστικές και θεραπευτικές προσεγγίσεις

Περίληψη

Η Πρωτεωμική είναι ένα σύνολο πολύπλοκων μεθόδων και τεχνολογιών που αποσκοπεί στην ταυτοποίηση, καταγραφή και μελέτη του ολικού πρωτεϊνικού περιεχομένου ενός βιολογικού υλικού. Περιλαμβάνει το διαχωρισμό των πρωτεϊνών ενός βιολογικού δείγματος, την ανάλυση τους με φασματομετρία μάζας, την ταυτοποίησή τους με τη χρήση εργαλείων βιοπληροφορικής, τη συστηματική εισαγωγή των αποτελεσμάτων σε βάσεις δεδομένων και, τέλος την επεξεργασία τους. Οι πλέον εύχρηστες μέθοδοι για την ταυτοποίηση των πρωτεϊνών είναι αυτές που αξιοποιούν το πεπτιδικό αποτύπωμά τους (peptide finger-print) και αναλύουν την αμινοξική αλληλουχία των πεπτιδίων τους. Τα σημαντικότερα μειονεκτήματα αυτών των μεθόδων είναι πως για την ασφαλή ταυτοποίηση μίας πρωτεΐνης, απαιτείται η ανάλυση τουλάχιστον δύο πεπτιδίων ανά πρωτεΐνη καθώς και ότι πολλά από τα πεπτίδια που ταυτοποιούνται από το φασματογράφο μάζας δεν οδηγούν τελικά σε ασφαλή χαρακτηρισμό μίας πρωτεΐνης και απορρίπτονται κατά τη βιοπληροφορική επεξεργασία. Οι παρα ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Proteomics are comprised of a setoff complex methods and technologies that aim to identify, register, and study the total protein content of a biological sample. It includes protein separation, mass spectrometry analysis, protein identification using bioinformatics tools, systematic introduction of the results in databases and analysis of the results. The most easy-to-use methods for protein identification are those that utilize the peptide fingerprint and analyze the amino acid sequence of their peptides. The biggest disadvantages of these methods are that they require the analysis of at least two peptides for every protein to allow for safe identification as well as that many of the peptides that are identified by mass spectrometry do not eventually lead to safe identification of a protein and are rejected throughout the bioinformatics process. The weaknesses mentioned above lead to the need to develop a new approach to identify the proteins of an organism. This approach was based on ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/54303
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/54303
ND
54303
Εναλλακτικός τίτλος
Systemic decoding of the human uniquome: evolutionary, mechanistic and therapeutic approaches
Συγγραφέας
Κοντοπόδης, Ευάγγελος (Πατρώνυμο: Μιχαήλ)
Ημερομηνία
2023
Ίδρυμα
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ). Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Βιολογίας. Τομέας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Βοργιάς Κωνσταντίνος
Στραβοπόδης Δημήτρης
Παπασιδέρη Ισιδώρα
Τσιτσιλώνη Ουρανία
Παυλόπουλος Γεώργιος
Ηλιόπουλος Ηλίας
Κατσαφάδου Αγγελική
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές ΕπιστήμεςΒιολογία ➨ Βιολογία
Λέξεις-κλειδιά
Μοναδικά πεπτίδια; Μοναδικά πεπτίδια ελάχιστου μήκους; Σύνθετα μοναδικά πεπτίδια; Πρωτεωμική; Πεπτιδομική
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
εικ., πιν., σχημ., γραφ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.