Ανίχνευση γενετικών τόπων - δεικτών του ξενιστή, που εμπλέκονται στη βαρύτητα ιογενών αναπνευστικών λοιμώξεων

Abstract

Influenza remains an important threat for human health, despite the extensive study of influenza viruses and the production of effective vaccines. In contrast to virus genetics determinants, host genetic factors with clinical impact remained unexplored until recently. The association between three single nucleotide polymorphisms (SNPs) and influenza outcome in a European population was investigated in the present study. All samples were collected during the influenza A(H1N1)pdm09 post-pandemic period 2010-11 and a sufficient number of severe and fatal cases was included. Host genomic DNA was isolated from pharyngeal samples of 110 patients from northern Greece with severe (n = 59) or mild (n = 51) influenza A(H1N1)pdm09 disease, at baseline, and the genotype of CD55 rs2564978, C1QBP rs3786054 and FCGR2A rs1801274 SNPs was investigated. Our findings suggest a relationship between the two complement-related SNPs, namely, the rare TT genotype of CD55 and the rare AA genotype of C1QBP with increased death risk. No significant differences were observed for FCGR2A genotypes neither with fatality nor disease severity. Additional large-scale genetic association studies are necessary for the identification of reliable host genetic risk factors associated with influenza A(H1N1)pdm09 outcome. Prophylactic intervention of additional high-risk populations, according to their genetic profile, will be a key achievement for the fight against influenza viruses.

Οι ιογενείς αναπνευστικές λοιμώξεις, αποτέλεσαν και συνεχίζουν να αποτελούν σημαντικό παράγοντα νοσηρότητας και θνησιμότητας, παρά τα προγράμματα εντατικής επιτήρησης. Μετά και την πρόσφατη πανδημία γρίπης Α(Η1Ν1) 2009, έχει δοθεί ιδιαίτερη έμφαση στην κατανόηση των καθοριστικών παραγόντων και της παθογένεσης των σοβαρών αναπνευστικών λοιμώξεων. Το μεγαλύτερο μέρος της μέχρι τώρα βιβλιογραφίας έχει επικεντρωθεί στη μελέτη της γενετικής των ιών για την ανίχνευση των στοιχείων εκείνων που καθιστούν ορισμένα στελέχη ιδιαίτερα παθογονικά. Ωστόσο, απουσιάζουν επί του παρόντος βιβλιογραφικά δεδομένα που να περιγράφουν τους πιθανούς καθοριστικούς γενετικούς παράγοντες του ξενιστή που προκαλούν ευαισθησία σε λοίμωξη από αναπνευστικούς ιούς και μπορεί να οδηγήσουν σε σοβαρές αναπνευστικές παθολογικές καταστάσεις.Από τα 1847 δείγματα της μεταπανδημικής περιόδους 2010-11 που ελέγχθηκαν για τον ιό της γρίπης Α(Η1Ν1)pdm09 επιλέχθηκαν ύστερα από ορισμό κριτηρίων αποκλεισμού 110 δείγματα για γονοτυπικό έλεγχο και έλεγχο του λόγου των σχετικών πιθανοτήτων με την έκβαση της νόσου. Οι πολυμορφισμοί που μελετήθηκαν σχετίζονται με την ανοσιακή απάντηση και συγκεκριμένα είναι οι: CD55 rs2564978, C1QBP rs3786054 και FCGR2A rs1801274. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι οι πολυμορφισμοί CD55 rs2564978, C1QBP rs3786054 που σχετίζονται με το συμπλήρωμα, δηλαδή ο σπάνιος γονότυπος TT του CD55 καθώς και ο σπάνιος AA γονότυπος του C1QBP, συνδέονται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο θανάτου, αλλά όχι με τη σοβαρότητα της νόσου. Αντιθέτως δεν παρατηρήθηκαν σημαντικές διαφορές σε κανένα επίπεδο για τους γονοτύπους rs1801274 του FCGR2A γονιδίου.Με την αναγνώριση του ρόλου της γενετικής ποικιλότητας του ξενιστή, καθώς και με τον εντοπισμό των βασικών πολυμορφισμών που μειώνουν την ανοσιακή απάντηση ή σχετίζονται με την προστασία, θα είμαστε σε θέση να αναγνωρίζουμε υποπληθυσμούς/άτομα υψηλού κινδύνου οι οποίοι θα μπορούν να λάβουν προφυλακτικά μέτρα, αλλά θα οδηγήσουν και στη διασάφηση-αναγνώριση των κύριων πρωτεϊνών του ξενιστή που παίζουν σημαντικό ρόλο στην αλληλεπίδραση μεταξύ ιού και ξενιστή για τον καλύτερο σχεδιασμό φαρμακευτικών σκευασμάτων και εμβολίων.