Συσχέτιση της παχυσαρκίας με πολυμορφισμούς γονιδίων σε δείγμα ελληνικού πληθυσμού

Abstract

Obesity is the result of an imbalance between energy expenditure and itsintake. This process is under the supervision of genetic and environmentalfactors. The purpose of this study is to investigate the possible association of all genes associated with obesity in the Greek population. The sample consists of 1,516 individuals, 799 (52.7%) women and 717(47.3%) men. 1.364 (90%) were normal and 152 (10%) were overweight orobese. The genomic DNA used was isolated from the epithelial cells of the oralcavity and the clot. For the isolation and proliferation of a particular DNA sequence by enzymatic production of DNA, without the use of living organisms,real time PCR was used. For each gene studied, an analysis of the distribution (wild type,heterozygous, homozygous) with respect to the group (normal vs overweight orobese) was made. The corresponding statistical test in such cases is x2 as homogenity test of the distribution between the two groups. If we have p <0,05,we reject the null hypothesis of homogenity of the distribution, which means that this gene is probably associated with obesity. Besides, in cases where we would accept statistical significance, the allocation of the two alleles in the healthy population should follow the Hardy-Weinberg equilibrium. Of the total of 82 polymorphisms of the genes studied, only two were associated with obesity in the Greek population: The UCP / rs660339 and theGSTP1 / rs1138272. Therefore, the presence of the T allele of the polymorphism at positions rs660339 and rs1138272 is a predisposing factor forobesity. These two polymorphisms belong to the group of oxidative stress, which shows that the antioxidant capacity of the body affects the appearance orthe course of the disease.

Η παχυσαρκία είναι αποτέλεσμα της ανισορροπίας μεταξύ της δαπάνης ενέργειας και της πρόσληψης αυτής. Αυτή η διεργασία βρίσκεται υπό την επίβλεψη περιβαλλοντικών και γενετικών παραγόντων. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι να ερευνήσουμε την πιθανή συσχέτιση όλων των γονιδίων που συνδέονται με την παχυσαρκία στον Ελληνικό πληθυσμό. Το δείγμα αποτελείται από 1.516 άτομα, 799 (52,7%) γυναίκες και 717(47,3%) άνδρες. 1.364 (90%) ήταν φυσιολογικοί και 152 (10%) ήταν υπέρβαροι ή παχύσαρκοι. Το γενομικό DNA που χρησιμοποιήθηκε απομονώθηκε από τα επιθηλιακά κύτταρα της στοματικής κοιλότητας και το ολικό αίμα. Για την απομόνωση και τον πολλαπλασιασμό μίας συγκεκριμένης αλληλουχίας DNA μέσω ενζυμικής παραγωγής του DNA, χωρίς τη χρήση ζωντανών οργανισμών,χρησιμοποιήθηκε real time PCR. Για το κάθε γονίδιο που μελετήθηκε, έγινε ανάλυση της κατανομής του(wild type, ετερόζυγους, ομόζυγους) σε σχέση με την ομάδα (φυσιολογικοί vsυπέρβαροι ή παχύσαρκοι). Το αντίστοιχο στατιστικό τεστ σε αυτές τις περιπτώσεις είναι το x2 ως τεστ ομοιογένειας της κατανομής μεταξύ των δύο ομάδων. Σε περίπτωση που έχουμε p < 0,05, απορρίπτουμε τη μηδενική υπόθεση της ομοιογένειας της κατανομής, που σημαίνει ότι το γονίδιο αυτό πιθανόν έχει σχέση με την παχυσαρκία. Πέραν αυτού, στις περιπτώσεις που θα αποδεχθούμε τη στατιστική σημαντικότητα, πρέπει η κατανομή των δύο αλληλίων στον υγιή πληθυσμό να ακολουθεί την ισορροπία κατά Hardy-Weinberg. Από το σύνολο των 82 πολυμορφισμών των γονιδίων που μελετήθηκαν,μόνο δύο συσχετίστηκαν με την παχυσαρκία στον Ελληνικό πληθυσμό: τοUCP / rs660339 και το GSTP1 / rs1138272. Συνεπώς, η παρουσία των Τ αλληλίων των πολυμορφισμών στις θέσεις rs660339 και rs1138272 αποτελεί προδιαθεσικό παράγοντα για παχυσαρκία. Οι δύο παραπάνω πολυμορφισμοί ανήκουν στην ομάδα του οξειδωτικού στρες, γεγονός που αποδεικνύει ότι η αντιοξειδωτική ικανότητα ενός οργανισμού επηρεάζει την εμφάνιση ή και την πορεία της νόσου