Μελέτη σχέσης δομής - βιολογικής δράσης αντιϋπερτασικών ενώσεων μέσω τεχνικών μοριακής μοντελοποίησης και φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR)

Abstract

Arterial blood pressure is regulated by the renin-­‐angiotensin system in which the angiotensin II receptor and renin play a significant role. During this research procedure, in silico methods were utilized in order to examine the function of these proteins upon ligand binding. Conformational and energetic changes of the drug aliskiren upon it’s binding to the human renin were studied, as well as structural properties of the complexes between angiotensin II and it’s antagonists, bound to angiotensin type 1 receptor (AT1). Experimental structural data and binding results were utilized in conformational search, homology modeling, docking calculations and molecular dynamics studies in order to gain information on these receptor-­‐ligand complexes so to be used in ligand and receptor based drug design.

Η αρτηριακή πίεση ρυθμίζεται μέσω του συστήματος ρενίνης-­‐αγγειοτασίνης στο οποίο εμπλέκονται ο υποδοχέας της αγγειοτασίνης ΙΙ και η ρενίνη. Στην παρούσα ερευνητική εργασία, χρησιμοποιήθηκαν in silico τεχνικές για τη μελέτη της λειτουργίας των συμπλόκων αυτών των πρωτεϊνών με τους βιοδραστικούς προσδέτες τους. Μελετήθηκαν οι διαμορφωτικές και ενεργειακές αλλαγές στις οποίες υπόκειται η αλισκιρένη κατά την πρόσδεση στη ρενίνη και τα δομικά χαρακτηριστικά των συμπλόκων μεταξύ της αγγειοτασίνης ΙΙ και ενός μεγάλου αριθμού ανταγωνιστών της με τον υποδοχέα της (ΑΤ1). Στους υπολογισμούς ενσωματώθηκαν πειραματικά δεδομένα σχετικά με τη διαμόρφωση ή την ισχύ πρόσδεσης αυτών των μορίων προκειμένου να δημιουργηθούν αξιόπιστα μοντέλα που να προσομοιάζουν την βιολογική δράση αυτών των συμπλόκων και να χρησιμοποιηθούν για σχεδιασμό νέων δραστικών ενώσεων.