Ρόλος της 5΄ μη μεταφραζόμενης περιοχής (5΄ UTP) στη γονιδιακή έκφραση του ιού της ηπατίτιδας C (HCV)

Abstract

Η 5' ΜΗ ΜΕΤΑΦΡΑΖΟΜΕΝΗ ΠΕΡΙΟΧΗ (5' UTR)ΤΟΥ ΙΟΥ ΤΗΣ ΗΠΑΤΙΤΙΔΑΣ C (HCV) ΕΙΝΑΙ ΙΔΙΑΙΤΕΡΑ ΕΠΙΜΗΚΗΣ ΚΑ ΠΑΡΟΥΣΙΑΖΕΙ ΕΝΤΟΝΗ ΔΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗ ΔΟΜΗ . ΕΝΑ ΙΔΙΑΙΤΕΡΟ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΟ ΤΗΣ ΑΠΟΤΕΛΕΙ Η ΠΑΡΟΥΣΙΑ ΠΟΛΛΑΠΛΩΝ ΜΙΚΡΩΝ ΑΝΟΙΚΤΩΝ ΠΛΑΙΣΙΩΝ ΑΝΑΓΝΩΣΗΣ ΠΟΥ ΠΡΟΗΓΟΥΝΤΑΙ ΤΟΥ ΚΩΔΙΚΟΝΙΟΥ ΕΝΑΡΞΗΣ ΤΗΣ ΠΟΛΥΠΡΩΤΕΙΝΗΣ . Η ΣΗΜΑΣΙΑ ΤΩΝ ΠΛΑΙΣΙΩΝ ΑΝΑΓΝΩΣΗΣ ΑΥΤΩΝ ΠΑΡΑΜΕΝΕΙ ΑΔΙΕΥΚΡΙΝΙΣΤΗ ΑΦΟΥ ΤΟ ΡΙΒΟΣΩΜΑ ΠΙΣΤΕΥΕΤΑΙ ΟΤΙ ΠΡΟΣΔΕΝΕΤΑΙ ΚΑΤΕΥΘΕΙΑΝ ΣΤΟ ΕΝΑΡΚΤΗΡΙΟ AUGO ΟΠΙΘΑΝΟΣ ΡΟΛΟΣ ΤΟΥ ΜΕΛΕΤΗΘΗΚΕ ΜΕ ΠΕΙΡΑΜΑΤΑ ΚΑΤΕΥΘΥΝΟΜΕΝΗΣ ΜΕΤΑΛΑΞΟΓΕΝΕΣΗΣ ΣΥΜΦΩΝΑ ΜΕ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ ΤΗΝ ΜΕΛΕΤΗΣ ΜΑΣ ΔΕΝ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΛΕΙΣΤΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΑΝΑΓΝΩΡΙΣΗΣ ΤΟΥ 3ου AUG ΑΠΟ ΤΟ ΡΙΒΟΣΩΜΑ , ΕΝΩ ΑΝΤΙΘΕΤΑ ΥΠΑΡΧΟΥΝ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΕΣ ΕΝΔΕΙΞΕΙΣ ΕΝΑΝΤΙ ΤΗΣ ΥΠΟΘΕΣΗΣ ΤΗΣ ΜΕΤΑΦΡΑΣΗΣ ΤΟΥ 4ου ΚΑΙ 5ου AUG. ΣΤΗΝ 5'UTR ΤΟΥ HCV ΕΠΙΠΛΕΟΝ Η ΠΡΟΣΘΗΚΗ ΜΙΑΣ ΤΡΙΠΛΕΤΑΣ ΕΝΑΡΞΗΣ AUG ΠΡΙΝ ΤΟ ΕΝΑΡΚΤΗΡΙΟ ΚΩΔΙΚΟΝΙΟ ΑΠΟΚΑΛΥΨΕ ΕΝΑ ΚΑΙΝΟΥΡΓΙΟ ΤΜΗΜΑ ΣΤΗΝ ΠΕΡΙΟΧΗ ΤΗΣ 5'UTR ΣΤΟΝ HCV ΑΠΑΡΑΙΤΗΤΟ ΓΙΑ ΤΗΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑ ΤΟΥ IRES ΤΟΥ ΙΟΥ , ΤΟΝ ΒΡΟΓΧΟ ΤΕΣΣΑΡΩΝ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΩΝ ΙΙΙE.

THE 5' UNTRASLATED REGION (5'UTR) OF HEPATITIS COUIRUS (HCV) IS RELATIVELY LONG AND FOLDS INTO A COMPLEX SECONDARY STRUCTURE HARBORING AN INTERNAL RIBOSOME ENTRY SITE (IRES)THAT EXTENDS INTO THE CODING REGION OF THEVIRUS. AN INTERESTING FEATURE OF HCV IRES IS THE PRESENCE OF A NUMBER OF SMALL OPEN READINGS FRAMES OPSTREAN THE INITIATOR HUG. THE SIGNIFICANCE OF THESE SORFS REMAINS UNCLEAR INUSMUCH AS THE RIBOSOME APPEARS TO BIND DIRECTLY TO THE INITIATOR AUG. THEIR POTENTIAL ROLE WAS STUDIED IN SITE-DIRECTED MUTAGENESIS EXPERIMENTS .OUR RESULTS PROVIDE EXPERIMENTAL DATA AGAINST THE TRANSLATION OF THE 4TH AND 5TH AUG IN HCV 5'UTR. IN CONTRAST THEY CANNOT RULE OUT THE POSSIBILITY THAT THE RIBOSOME CAN RECOGNISE THE 3TD AUG.MOREOVER, THE INTODUCTION OF AN ADDITIONAL AUG AT NT 298 REVEALED A NEW CIS-ACTING ELEMENT ABSOLUTELY ESSENTIAL FOR HCV IRES: TETRALOOP IIIE